MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli KO11FL chromosome

Total Repeats: 12492

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016902	AAG	2	6	6190	6195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016902	ATC	2	6	6215	6220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016902	ATC	2	6	6252	6257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016902	CTT	2	6	8381	8386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016902	CCT	2	6	8389	8394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016902	T	7	7	8442	8448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016902	GTA	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016902	CAA	2	6	8483	8488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016902	TAC	2	6	8499	8504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016902	TCA	2	6	8530	8535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016902	TAC	2	6	8542	8547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016902	ATCG	2	8	8566	8573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016902	AGA	2	6	8585	8590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016902	TCAC	2	8	14403	14410	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016902	TCA	2	6	14413	14418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016902	ATG	2	6	14463	14468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016902	TGA	2	6	16081	16086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016902	CAT	3	9	16114	16122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016902	GGC	2	6	16136	16141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016902	TGC	2	6	16162	16167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016902	A	8	8	16200	16207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016902	ACCTG	2	10	16294	16303	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_016902	GCC	2	6	16776	16781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_016902	TACT	2	8	16846	16853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016902	CTT	2	6	16856	16861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016902	TGG	2	6	17334	17339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016902	T	7	7	17343	17349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016902	TCTT	2	8	17351	17358	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016902	CAA	2	6	17362	17367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016902	T	6	6	19889	19894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016902	A	6	6	19942	19947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016902	T	8	8	19952	19959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016902	GTC	2	6	20071	20076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016902	GC	3	6	21913	21918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016902	ACC	2	6	21990	21995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016902	A	6	6	22078	22083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016902	GTT	2	6	22101	22106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016902	CGG	2	6	22127	22132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016902	GGC	2	6	22158	22163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016902	TGG	2	6	22174	22179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016902	ACT	2	6	22219	22224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016902	GCA	2	6	22233	22238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016902	CGT	2	6	22257	22262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016902	TTG	2	6	22333	22338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016902	CTA	2	6	22370	22375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016902	TGG	2	6	22389	22394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016902	CAA	2	6	22573	22578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016902	ACG	2	6	23560	23565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016902	ACATAA	2	12	23634	23645	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016902	TGA	2	6	26879	26884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016902	CGG	2	6	26890	26895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016902	ATT	2	6	26898	26903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016902	CCT	2	6	27366	27371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016902	A	9	9	27420	27428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016902	AAT	2	6	29878	29883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016902	TGA	2	6	29936	29941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016902	GGGA	2	8	30021	30028	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016902	ACC	2	6	30073	30078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_016902	TGT	2	6	30428	30433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016902	TTG	2	6	30465	30470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016902	CAC	2	6	30512	30517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_016902	TAAA	2	8	30606	30613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016902	ACT	2	6	30955	30960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016902	CCG	2	6	30975	30980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_016902	GTC	2	6	30986	30991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016902	GTG	3	9	30998	31006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016902	GTC	2	6	31007	31012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016902	AAC	2	6	31035	31040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016902	AC	3	6	31039	31044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016902	CCG	2	6	31057	31062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_016902	CGGG	2	8	31071	31078	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016902	AGA	2	6	31114	31119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016902	AAC	2	6	33130	33135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016902	T	9	9	33163	33171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016902	TGC	2	6	36693	36698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016902	ATGC	2	8	36710	36717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016902	T	6	6	38178	38183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016902	ATT	3	9	39981	39989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016902	ATT	2	6	40012	40017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016902	GTT	2	6	40068	40073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016902	TCC	2	6	40107	40112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016902	AAG	2	6	43376	43381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016902	AGT	2	6	43390	43395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016902	TCA	2	6	43763	43768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016902	AAG	2	6	43799	43804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016902	CGTTT	2	10	43853	43862	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016902	T	6	6	43860	43865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016902	TAA	2	6	43904	43909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016902	TATG	2	8	45696	45703	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016902	A	6	6	46982	46987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016902	GTATT	2	10	47023	47032	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016902	ATT	2	6	47104	47109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016902	AATT	2	8	47127	47134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016902	TA	3	6	47143	47148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016902	TTGAT	2	10	47199	47208	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016902	AT	3	6	47207	47212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016902	ATT	2	6	47245	47250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016902	T	7	7	47269	47275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016902	AATAG	2	10	47292	47301	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016902	A	6	6	47308	47313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016902	ACA	2	6	47335	47340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016902	AGA	2	6	48069	48074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016902	AGAA	2	8	49192	49199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016902	A	6	6	50097	50102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016902	T	7	7	50645	50651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016902	TGACCG	2	12	50698	50709	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016902	CACTT	2	10	50804	50813	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_016902	TTA	2	6	51656	51661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016902	TTA	2	6	51760	51765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016902	TCAG	2	8	51852	51859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016902	TGA	2	6	53369	53374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016902	A	6	6	53384	53389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016902	TTA	2	6	53484	53489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016902	CGAT	2	8	53503	53510	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016902	ATT	2	6	53516	53521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016902	ATT	2	6	53539	53544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016902	ATCG	2	8	53550	53557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016902	ACA	2	6	53560	53565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016902	GTA	2	6	53619	53624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016902	A	6	6	53633	53638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016902	CAAT	2	8	53707	53714	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016902	A	6	6	55066	55071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016902	CAG	2	6	55127	55132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016902	TA	3	6	55163	55168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016902	GCC	2	6	55246	55251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_016902	TCC	2	6	55257	55262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_016902	ATTC	2	8	55265	55272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016902	TTTA	2	8	55591	55598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016902	TAC	2	6	55608	55613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016902	CAA	2	6	55643	55648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016902	CA	3	6	55711	55716	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016902	CTGG	2	8	55800	55807	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016902	CTA	2	6	56896	56901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016902	T	6	6	56929	56934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016902	ATG	2	6	56952	56957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016902	ACGC	2	8	56976	56983	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016902	TTGATT	2	12	57031	57042	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016902	CATTG	2	10	57043	57052	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_016902	CAA	2	6	57134	57139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016902	TCA	2	6	57198	57203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016902	ACC	3	9	57212	57220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_016902	CGA	2	6	57238	57243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016902	CTG	2	6	57284	57289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016902	ACTG	2	8	57318	57325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016902	T	6	6	57418	57423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016902	TGT	2	6	57467	57472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016902	CAG	2	6	58042	58047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_016902	TCA	2	6	58073	58078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_016902	CAT	2	6	58115	58120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_016902	CAT	2	6	58266	58271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_016902	TGGA	2	8	58292	58299	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016902	A	6	6	58308	58313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016902	CAT	2	6	58350	58355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_016902	T	6	6	58365	58370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_016902	ATTT	2	8	61752	61759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016902	TAA	2	6	61795	61800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016902	C	6	6	63072	63077	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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160	NC_016902	TAT	2	6	63154	63159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_016902	GCC	2	6	63268	63273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_016902	GAC	2	6	63282	63287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_016902	T	6	6	63368	63373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016902	TAT	2	6	63393	63398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_016902	AT	3	6	63442	63447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_016902	TAA	2	6	63495	63500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_016902	GAA	2	6	78116	78121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_016902	GTT	2	6	78876	78881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_016902	TCTG	2	8	81345	81352	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
179	NC_016902	T	6	6	81390	81395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_016902	CTT	2	6	81469	81474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_016902	A	6	6	81494	81499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_016902	TA	3	6	82496	82501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_016902	ATG	2	6	125791	125796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_016902	AG	3	6	130976	130981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
278	NC_016902	TGACG	2	10	130987	130996	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
279	NC_016902	TCA	2	6	130998	131003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_016902	CAA	2	6	131025	131030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_016902	GGC	2	6	131031	131036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_016902	AGT	2	6	131067	131072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_016902	TTTTG	2	10	131080	131089	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
285	NC_016902	TTG	2	6	131095	131100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_016902	TCA	2	6	131205	131210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_016902	ATT	2	6	131220	131225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_016902	ATT	2	6	131258	131263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_016902	ACA	2	6	131307	131312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_016902	G	6	6	132847	132852	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
291	NC_016902	ATT	2	6	132885	132890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_016902	GAT	2	6	132915	132920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_016902	T	6	6	132976	132981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_016902	TCG	2	6	133017	133022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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300	NC_016902	GAT	2	6	133103	133108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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410	NC_016902	TAC	2	6	183656	183661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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416	NC_016902	A	6	6	184350	184355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
417	NC_016902	T	6	6	184372	184377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
418	NC_016902	ACA	2	6	184387	184392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
419	NC_016902	GT	3	6	184495	184500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
420	NC_016902	T	7	7	184511	184517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_016902	TC	3	6	186275	186280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
422	NC_016902	ATG	2	6	186316	186321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NC_016902	GAA	2	6	186332	186337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_016902	GTAA	2	8	187136	187143	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_016902	AAC	2	6	191375	191380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
430	NC_016902	ATA	2	6	191413	191418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_016902	AAT	2	6	191428	191433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_016902	TCAT	2	8	191441	191448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
433	NC_016902	TTA	2	6	191552	191557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_016902	ATT	2	6	193676	193681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_016902	A	6	6	208805	208810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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